Die Steuerung des S5 ist einfach und bequem. Mit dem Controller für iPhone, der im iTunes App Store heruntergeladen werden kann, verwandeln sich iPhone und iPod touch in vollwertige Sonos Controller. Bequem kann man nach Songs oder Radiosendern suchen, sie auswählen und abspielen sowie die Lautstärke in allen Räumen regeln, die mit ZonePlayern ausgestattet sind. Da das iPhone als Controller dient und nicht als Audio-Quelle, kann man weiterhin telefonieren oder eine SMS schreiben, ohne dass die Musik stoppt. Und man kann sein iPhone jederzeit bei sich tragen, da es nicht in einem Dock platziert werden muss. Jeder S5 wird zudem mit der Sonos Controller für Mac oder PC ausgeliefert, der separat erhältliche Sonos Controller 200 ergänzt das System auf Wunsch.